ويتبع هيئة موانئ البحر الأحمر الموانئ التالية

أولاً: الموانئ التجارية

1 – ميناء السويس 2 – حوض البترول

3 – الأدبية 4 – السخنة

5 – الغردقة 6 – سفاجا

7 –الطور 8 – شرم الشيخ

9- نويبع



كما يخضع لإشراف الهيئة مجموعة من الموانئ التعدينية والتخصصية التى تقع فى نطاق الموانئ.



(أ) موانئ بترولية

1- ميناء سوميد بالعين السخنة 2- ميناء رأس غارب

3- رصيف المشروعات بالزيتيات.



(ب) موانى تعدينية

1- ميناء القصير 2- ميناء الحمراوين

3- ميناء أبو الغصون 4-- ميناء أبو زنيمة

5- ميناء سفاجا التعدينى 6- رصيف ابوطرطور

7- رصيف رأس الحجرية

(ت) موانى صيد

1- ميناء الصيد بالاتكة 2- ميناء الصيد بالطور

تتولى الهيئة العامة لموانئ البحر الأحمر الإشراف على الموانئ التابعة لها بثلاثة محافظات السويس – جنوب سيناء – البحر الأحمر.